Op. Dr. Gülçin Babayeva, lisans öncesi eğitimlerini tamamladıktan sonra Azerbaycan Tıp Üniversitesinde aldığı eğitimi başarıyla tamamlayarak Tıp Doktoru Ünvanı almıştır. Ardından Necmettin Erbakan Üniversitesi'de ihtisasını tamamlayıp Kadın Hastalıkları ve Doğum Uzmanı olmuştur.